SC Microbiologia e Virologia

L’attività della Struttura si articola in vari settori disciplinari: Virologia, Batteriologia, Micologia e Parassitologia.

È dotata di laboratori di diagnosi molecolare a basso biocontenimento (BLS2), di laboratori per l'isolamento virale e le indagini sierologiche di neutralizzazione ad elevato contenimento (BLS3) e di laboratori per le indagini molecolari avanzate (incluse indagini NGS e MOGM) a contenimento speciale (MOGM classe II).

Il laboratorio è operativo h24, 7 giorni su 7. Il servizio di guardia notturna e quello attivo nei giorni festivi garantisce l'esecuzione degli esami microbiologici urgenti.

Alla Struttura Complessa di Microbiologia e Virologia afferiscono la Struttura Semplice AMR – Stewardship Microbiologica, la Struttura Semplice Laboratorio di genomica e bio informatica, la Struttura Semplice Sorveglianza di Laboratorio.

L’attività clinica del laboratorio è articolata su diversi ambiti per garantire la migliore e più aggiornata offerta diagnostica nei seguenti ambiti:

• diagnostica etiologica avanzata delle infezioni batteriche, virali, fungine e parassitarie (sia quelle normalmente riscontrabili sul territorio che quelle di importazione e quelle di origine animale);
• diagnostica avanzata completa della risposta immunologica (sia di tipo umorale che cellulo-mediata) alle infezioni;
• supporto di consulenza ai reparti clinici per gli approcci diagnostici (diagnostic stewardship) che di terapia, individuando gli antimicrobici maggiormente attivi o combinazioni maggiormente efficaci (antimicrobial-stewardship);
• sorveglianza epidemiologica degli agenti patogeni sia in sede locale che Regionale, Nazionale ed Internazionale;
• gestione, in collaborazione con gli specialisti Infettivologi, dell’ambulatori delle malattie a trasmissione sessuale, delle infezioni in gravidanza e quello per il controllo del rischio tubercolare.

La Struttura di Microbiologia e Virologia è un centro di eccellenza riconosciuto sia a livello nazionale che internazionale e si distingue per diverse attività affrontate con approcci innovativi:

• Attività in ambito di salute pubblica (diagnosi e sorveglianza delle infezioni emergenti e riemergenti), inclusa l’epidemiologia molecolare delle infezioni e la risposta immunologica alle vaccinazioni in qualità di Centro di Riferimento nell’ambito di reti istituzionali;
• Protocolli diagnostico-terapeutici avanzati per la lotta alla sepsi;
• Patogenesi delle infezioni virali opportunistiche nei pazienti immunocompromessi (trapiantati di organo solido o di cellule staminali emopoietiche, pazienti in terapia con farmaci biologici e pazienti HIV);
• Diagnostica, sorveglianza ed epidemiologia delle infezioni correlate all’assistenza e da patogeni multiresistenti;
• Indagini di alta specializzazione per la definizione ed il tracciamento delle infezioni batteriche multiresistenti;
• Meccanismi molecolari di resistenza a farmaci antimicrobici (antibiotici ed antivirali);
• Sviluppo di una piattaforma di intelligenza artificiale e data mining per il controllo delle infezioni ospedaliere;
• Identificazione e monitoraggio di infezioni fungine invasive;
• Indagini di alta specializzazione e counselling in ambito materno-infantile (diagnosi e prognosi di infezioni virali, batteriche e parassitarie in gravidanza);
• Diagnosi morfologica e molecolare di parassitosi d’importazione;
• Microbiota intestinale e traslocazione microbica nei pazienti con emolinfopatie;
• Innovazione tecnologica mediante sviluppo di nuovi approcci diagnostici;
• Partecipazione board scientifici per stesura di linee guida Nazionali ed Internazionali per la diagnosi e la terapia delle infezioni.

Reti

• Centro di riferimento regionale per Arbovirus e febbri emorragiche;
• Centro di Riferimento della Regione Lombardia e del Ministero della Salute sorveglianza dell’infezione e della genotipizzazione da SARS-CoV-2 (CovidNET);
• Centro di Riferimento della Regione Lombardia e del Ministero della Salute sorveglianza dell’infezione da influenza per casi gravi (InfluNET);
• Centro di Riferimento della Regione Lombardia e del Ministero della Salute diagnosi di infezione e sorveglianza del virus del Morbillo e della Rosolia (MoRoNET);
• Centro di riferimento regionale per la diagnosi, il trattamento ed il follow up delle infezioni congenite da toxoplasmosi, CMV e lue;
• Centro MST di secondo livello (Malattie Sessualmente Trasmissibili).

Accreditamenti istituzionali

Accreditamento al Laboratorio Nazionale di Riferimento per il Morbillo e Rosolia (LNR) presso l’Istituto Superiore di Sanità.

In parallelo alla parte assistenziale sono attive, presso la Struttura, numerose linee di ricerca che si sviluppano nelle seguenti attività:

• sviluppo e validazione clinica di nuovi test molecolari, sierologici e immunologici per la diagnosi e il monitoraggio delle malattie virali;
• studio della patogenesi delle infezioni virali opportunistiche in soggetti immunocompromessi e identificazione dei marcatori del rischio e della progressione della malattia;
• meccanismi molecolari della resistenza batterica e virale ai farmaci;
• gestione antimicrobica e sorveglianza molecolare dei microrganismi multiresistenti;
• infezioni durante la gravidanza e prevenzione delle infezioni congenite;
• studio degli aspetti patogenetici delle infezioni virali durante la gravidanza e identificazione dei parametri prognostici;
• epidemiologia molecolare delle infezioni virali emergenti, riemergenti e respiratorie;
• patogenesi dei tumori correlati ai virus.

La Struttura di Microbiologia e Virologia è attivamente impegnata nell’attività didattica come strumento di insegnamento e formazione. 

La Struttura è sede di:

• Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia per Medici;
• Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia per non-Medici;
• Scuole di Specializzazione di Area Sanitaria – Struttura di sede per attività professionalizzanti.

Inoltre, svolge le seguenti attività di formazione Universitaria e tutoraggio: 

• Corso di laurea in Medicina e Chirurgia in lingua Italiana (corso Golgi);
• Corso di laurea in Medicina e Chirurgia in lingua Inglese (corso Harvey);
• Scienze Infermieristiche;
• Biotecnologie Mediche e Farmaceutiche;
• Tecniche di Laboratorio Biomedico;
• Sede per attività di tirocinio degli studenti iscritti ai corsi di Laurea nelle Professioni Sanitarie e ad altri corsi di studio di UNIPV.